MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 47040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017482	GTG	2	6	184	189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826721
2	NC_017482	TCA	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826721
3	NC_017482	GCATCA	2	12	267	278	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385826721
4	NC_017482	CGATGA	2	12	285	296	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385826721
5	NC_017482	CAA	2	6	301	306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826721
6	NC_017482	CGG	2	6	392	397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826721
7	NC_017482	TTTA	2	8	442	449	25 %	75 %	0 %	0 %	385826721
8	NC_017482	CGG	2	6	450	455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826721
9	NC_017482	AAT	2	6	511	516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826721
10	NC_017482	TCCA	2	8	574	581	25 %	25 %	0 %	50 %	385826721
11	NC_017482	GTTG	2	8	633	640	0 %	50 %	50 %	0 %	385826721
12	NC_017482	TTC	2	6	652	657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826721
13	NC_017482	AAG	2	6	665	670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826721
14	NC_017482	AAG	2	6	677	682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826721
15	NC_017482	TTC	2	6	685	690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826721
16	NC_017482	CCG	2	6	823	828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826721
17	NC_017482	AGA	2	6	873	878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826721
18	NC_017482	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826721
19	NC_017482	GAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826721
20	NC_017482	A	6	6	1265	1270	100 %	0 %	0 %	0 %	385826721
21	NC_017482	ACC	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826721
22	NC_017482	ATG	2	6	1567	1572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826722
23	NC_017482	GCT	2	6	1698	1703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826722
24	NC_017482	GCA	2	6	1729	1734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826722
25	NC_017482	GC	3	6	1755	1760	0 %	0 %	50 %	50 %	385826722
26	NC_017482	TTC	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826722
27	NC_017482	CGTTGC	2	12	2042	2053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826722
28	NC_017482	CAG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826722
29	NC_017482	CAT	3	9	2120	2128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826722
30	NC_017482	TAT	2	6	2212	2217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826722
31	NC_017482	CTG	2	6	2331	2336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826722
32	NC_017482	AGC	2	6	2373	2378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826722
33	NC_017482	GTG	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826722
34	NC_017482	GAA	2	6	2460	2465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826722
35	NC_017482	CGA	3	9	3149	3157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826723
36	NC_017482	CAC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826723
37	NC_017482	TGAT	2	8	3221	3228	25 %	50 %	25 %	0 %	385826723
38	NC_017482	GCG	2	6	3230	3235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826723
39	NC_017482	CGT	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826723
40	NC_017482	A	6	6	3389	3394	100 %	0 %	0 %	0 %	385826724
41	NC_017482	GCAAG	2	10	3464	3473	40 %	0 %	40 %	20 %	385826724
42	NC_017482	GC	3	6	3510	3515	0 %	0 %	50 %	50 %	385826724
43	NC_017482	CAA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826724
44	NC_017482	GC	3	6	3567	3572	0 %	0 %	50 %	50 %	385826724
45	NC_017482	AATT	2	8	3616	3623	50 %	50 %	0 %	0 %	385826724
46	NC_017482	TCA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826724
47	NC_017482	GATCG	2	10	3654	3663	20 %	20 %	40 %	20 %	385826724
48	NC_017482	TTTG	2	8	3707	3714	0 %	75 %	25 %	0 %	385826724
49	NC_017482	GCG	2	6	3755	3760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826724
50	NC_017482	GGC	2	6	3920	3925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826724
51	NC_017482	TGC	2	6	3961	3966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826724
52	NC_017482	CAA	2	6	3996	4001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826724
53	NC_017482	TGC	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826724
54	NC_017482	AGC	2	6	4114	4119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826724
55	NC_017482	GAT	2	6	4167	4172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826724
56	NC_017482	CAG	2	6	4224	4229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826724
57	NC_017482	CAC	2	6	4232	4237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826724
58	NC_017482	AGTTA	2	10	4247	4256	40 %	40 %	20 %	0 %	385826724
59	NC_017482	GAT	2	6	4311	4316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826724
60	NC_017482	ATC	2	6	4425	4430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826724
61	NC_017482	AAGA	2	8	4525	4532	75 %	0 %	25 %	0 %	385826725
62	NC_017482	GAA	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
63	NC_017482	AAGA	2	8	4546	4553	75 %	0 %	25 %	0 %	385826725
64	NC_017482	GCA	2	6	4561	4566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826725
65	NC_017482	ATG	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
66	NC_017482	CAT	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826725
67	NC_017482	TTGAAG	2	12	4730	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
68	NC_017482	GAT	2	6	4771	4776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
69	NC_017482	GTC	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826725
70	NC_017482	GGT	2	6	4855	4860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826725
71	NC_017482	TGGCGG	2	12	4866	4877	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	385826725
72	NC_017482	CGG	2	6	4890	4895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
73	NC_017482	GTT	2	6	4954	4959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826725
74	NC_017482	CGG	2	6	4962	4967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
75	NC_017482	GAGCAT	2	12	5038	5049	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385826725
76	NC_017482	CCGGAT	2	12	5071	5082	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385826725
77	NC_017482	TGA	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
78	NC_017482	GCG	2	6	5188	5193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
79	NC_017482	GGC	2	6	5224	5229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
80	NC_017482	GAA	3	9	5256	5264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
81	NC_017482	CTG	2	6	5272	5277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826725
82	NC_017482	GGC	2	6	5398	5403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
83	NC_017482	GAT	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
84	NC_017482	GTT	2	6	5530	5535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826725
85	NC_017482	AGACCA	2	12	5570	5581	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385826725
86	NC_017482	GGT	2	6	5607	5612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826725
87	NC_017482	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826725
88	NC_017482	GCT	2	6	5716	5721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826725
89	NC_017482	AAG	2	6	5746	5751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
90	NC_017482	ACA	2	6	5792	5797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826725
91	NC_017482	GAA	2	6	5959	5964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
92	NC_017482	ATC	2	6	6043	6048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826725
93	NC_017482	CCGATG	2	12	6053	6064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385826725
94	NC_017482	GTT	2	6	6087	6092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826725
95	NC_017482	GCC	2	6	6156	6161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826725
96	NC_017482	ATG	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826725
97	NC_017482	GCC	2	6	6240	6245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826725
98	NC_017482	GCCA	2	8	6295	6302	25 %	0 %	25 %	50 %	385826725
99	NC_017482	ACC	2	6	6313	6318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826725
100	NC_017482	CGG	2	6	6418	6423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826725
101	NC_017482	GAA	2	6	6433	6438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826725
102	NC_017482	TTG	2	6	6449	6454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826725
103	NC_017482	AAC	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826725
104	NC_017482	GAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
105	NC_017482	ACGT	2	8	6649	6656	25 %	25 %	25 %	25 %	385826726
106	NC_017482	ATGA	2	8	6696	6703	50 %	25 %	25 %	0 %	385826726
107	NC_017482	AAG	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826726
108	NC_017482	TCG	2	6	6748	6753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826726
109	NC_017482	TGACGG	2	12	6878	6889	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385826726
110	NC_017482	GCG	3	9	6891	6899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826726
111	NC_017482	CAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826726
112	NC_017482	GATT	2	8	6968	6975	25 %	50 %	25 %	0 %	385826726
113	NC_017482	GTT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826726
114	NC_017482	GC	3	6	7023	7028	0 %	0 %	50 %	50 %	385826726
115	NC_017482	CTG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826726
116	NC_017482	ACC	2	6	7077	7082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826726
117	NC_017482	CCG	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826726
118	NC_017482	ATC	2	6	7138	7143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826726
119	NC_017482	CCA	2	6	7150	7155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826726
120	NC_017482	TTA	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826726
121	NC_017482	TGG	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826726
122	NC_017482	GAAAA	2	10	7386	7395	80 %	0 %	20 %	0 %	385826726
123	NC_017482	TGA	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
124	NC_017482	CCG	2	6	7460	7465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826726
125	NC_017482	AAT	2	6	7491	7496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826726
126	NC_017482	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826726
127	NC_017482	CGG	3	9	7626	7634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826726
128	NC_017482	GAA	2	6	7649	7654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385826726
129	NC_017482	ATT	2	6	7725	7730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826726
130	NC_017482	ATT	2	6	7938	7943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826726
131	NC_017482	ATG	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
132	NC_017482	CTG	2	6	7998	8003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826726
133	NC_017482	TGAAGA	2	12	8024	8035	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385826726
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135	NC_017482	GGT	2	6	8127	8132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826726
136	NC_017482	GAT	2	6	8163	8168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
137	NC_017482	TCG	2	6	8170	8175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826726
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140	NC_017482	CAA	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826726
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144	NC_017482	GCA	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826726
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146	NC_017482	CGG	2	6	8741	8746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826726
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148	NC_017482	TGA	2	6	8833	8838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
149	NC_017482	CCGG	2	8	8887	8894	0 %	0 %	50 %	50 %	385826726
150	NC_017482	CGA	2	6	8924	8929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826726
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152	NC_017482	CAG	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826726
153	NC_017482	TGA	2	6	9131	9136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826726
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155	NC_017482	TGG	2	6	9907	9912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826727
156	NC_017482	CGAA	2	8	9930	9937	50 %	0 %	25 %	25 %	385826727
157	NC_017482	TAA	2	6	9940	9945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385826727
158	NC_017482	TTG	2	6	9963	9968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385826727
159	NC_017482	TGG	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826727
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259	NC_017482	GAC	2	6	16885	16890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826738
260	NC_017482	CAG	2	6	16912	16917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826738
261	NC_017482	CAA	2	6	17271	17276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826739
262	NC_017482	GCT	2	6	17316	17321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826739
263	NC_017482	CTCGA	2	10	17409	17418	20 %	20 %	20 %	40 %	385826739
264	NC_017482	TTC	2	6	17523	17528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385826739
265	NC_017482	CG	3	6	17560	17565	0 %	0 %	50 %	50 %	385826739
266	NC_017482	GCT	2	6	17657	17662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826739
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276	NC_017482	TAC	2	6	18231	18236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826739
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284	NC_017482	GTA	2	6	19446	19451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826741
285	NC_017482	AT	4	8	19452	19459	50 %	50 %	0 %	0 %	385826741
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288	NC_017482	T	6	6	19525	19530	0 %	100 %	0 %	0 %	385826741
289	NC_017482	TGG	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826741
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291	NC_017482	ATC	2	6	19637	19642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826741
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294	NC_017482	T	6	6	19770	19775	0 %	100 %	0 %	0 %	385826741
295	NC_017482	TGG	2	6	19814	19819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385826741
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377	NC_017482	CAAAC	2	10	25027	25036	60 %	0 %	0 %	40 %	385826747
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379	NC_017482	GATTT	2	10	25232	25241	20 %	60 %	20 %	0 %	385826747
380	NC_017482	CAA	2	6	25271	25276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385826747
381	NC_017482	ATT	2	6	25286	25291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826747
382	NC_017482	TTA	2	6	25305	25310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385826747
383	NC_017482	AC	3	6	25331	25336	50 %	0 %	0 %	50 %	385826747
384	NC_017482	GATG	2	8	25422	25429	25 %	25 %	50 %	0 %	385826747
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386	NC_017482	GCG	2	6	25464	25469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826747
387	NC_017482	GAC	2	6	25808	25813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826748
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400	NC_017482	CAT	2	6	26206	26211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385826749
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462	NC_017482	CTG	2	6	30464	30469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385826752
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489	NC_017482	TTGG	2	8	32207	32214	0 %	50 %	50 %	0 %	385826753
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494	NC_017482	GGTT	2	8	32384	32391	0 %	50 %	50 %	0 %	385826753
495	NC_017482	CCG	2	6	32508	32513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385826753
496	NC_017482	TGAA	2	8	32584	32591	50 %	25 %	25 %	0 %	385826753
497	NC_017482	GCG	2	6	32667	32672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385826753
498	NC_017482	CAC	2	6	32696	32701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385826753
499	NC_017482	GAT	2	6	32702	32707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385826753
500	NC_017482	AGC	2	6	32739	32744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385826753

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